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MATLAB可以处理丙型肝炎病毒数据

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康奈尔CAC最近获得了高性能计算领域的优秀奖。国际数据公司(International Data Corporation)将这个奖项授予了他们,以表彰他们在MATLAB计算方面的工作。MATLAB计算让CDC更好地了解了丙型肝炎病毒中氨基酸的变化。

纽约伊萨卡岛mdash;在西雅图希尔顿举行的SC11国际高性能计算、网络、存储和分析会议上,康奈尔高级计算中心(CAC)获得了国际数据公司(IDC)颁发的高性能计算创新优秀奖。该奖项是为了使丙型肝炎病毒(HCV)的研究能够在位于康奈尔大学的一个远程实验MATLAB计算资源上进行。

来自疾病控制中心(CDC)的研究人员使用康奈尔大学的资源来生成更快的计算(超过175倍的加速速度),这提供了一个更好的理解协调氨基酸变异网络,可能使发现新的治疗目标的丙型肝炎病毒。

IDC的研究表明,高性能计算可以极大地提高ROI和科技进步。厄尔·约瑟夫说,项目副总裁,IDC的高性能计算。

每年每例肝移植的费用为28万美元,仅丙肝肝移植每年的总费用就接近3亿美元。此外,在不进行肝移植的情况下,丙型肝炎患者的平均寿命费用估计约为10万美元。假设被认为感染的450万美国人中有80%发展成慢性肝病,这个群体(360万)的总生命成本将达到今天惊人的3600亿美元。假设患者可以存活40年,美国慢性丙型肝炎患者每年的医疗费用可能高达90亿美元。

竞争力委员会谨向所有荣获高性能计算创新卓越奖的得奖者表示祝贺,并感谢所有提交参赛作品的人士。只有当这些例子的经济价值得到承认时,高性能计算对私营部门的重要性才能得到充分的认识。Cynthia McIntyre博士说,在竞争力委员会的HPC倡议的高级副总裁。

Cornell CAC systems和咨询人员配置MATLAB计算集群,并编写并行MATLAB客户端代码,提供透明的用户访问。CDC的研究人员随后能够在他们的桌面上使用MathWorks&rsquo制作他们的应用原型;并行计算工具箱,并无缝扩展到康奈尔集群使用MATLAB分布式计算服务器。

对HCV的研究只是保持MATLAB实验资源饱和的众多项目中的一个。David Lifka解释道,他是国家科学基金会资助的项目的首席研究员,该项目得到了戴尔、英特尔、微软和MathWorks的额外支持。在两年的时间里,该系统运行了超过50万个工作,在凝聚态物理、引力波探测、生物医学成像、整形外科、神经科学和光学等领域产生了新的科学见解和出版物。他指出。此外,项目合作伙伴普渡大学使该资源成为透明而高效的纳米技术应用计算引擎,全国各地的研究人员可以通过nanoHUB.org科学门户轻松访问该资源。

利用从项目中学到的经验教训,Cornell现在正在研究如何使用云计算作为一个灵活的平台来交付特定类型的HPC资源和软件。上个月,Cornell&rsquo推出了红云计划,包括一个带有虚拟服务器和虚拟磁盘的基础设施服务(IaaS)平台,以及一个以MATLAB分布式计算服务器和NVIDIA gpu增强性能为特色的软件服务(SaaS)。